日本順天堂醫院在日本醫院界中綜合排名第一。它在瓣膜疾病、呼吸內科與呼吸外科疾病、肺癌等疾病的治療方面，水平都是日本頂級的，其中接待肺癌患者人數在全日本排名第一。
1.早期肺癌治愈率95%
順天堂的呼吸外科憑借著高超的肺癌手術技術，被世界熟知。
在做肺部治療時，為保證盡量不破壞患者的肺組織，積極地引入微創手術。同時，術中還盡可能減少患者的肺功能損傷。正是由于有了這些措施，使該院早期肺癌術后的5年存活率達到了95%。
術中出血量及圍手術期并發癥發生率僅為其他醫療發達國家發生率的1/5，憑此實績該科室在世界胸外科領域受到了矚目和認可。
2.“更溫柔的治愈患者”
2015年獨立建科的消化器低侵襲外科，一直秉承“更溫柔的治愈患者”的外科精神為患者提供低侵襲治療。
低侵襲治療的理念就是：重視根治疾病的同時，讓患者早日回歸正常生活。
經過不斷努力，低侵襲治療不論在胃癌、食道胃接合部癌等的上部消化道的惡性疾病中，還是在胃粘膜下腫瘤、十二指腸腫瘤、食道裂孔疝、返流性食道炎等上消化道良性疾病的診療中，均逐步地得到世界的公認。
3.食道癌手術數量日本第一
順天堂醫院的食道?胃外科也處于世界頂尖水平。由于食道癌手術技術高超，2002年科室調整時，醫院將食道·胃外科獨立出來，令其專門對食道癌進行診斷、研究和治療。
2009年由梶山美明擔任主任教授后，更加專注于食道和胃疾病的研究，以高質量的淋巴結清除手術確保患者的高生存率，逐漸登上世界領先地位，每年進行的食道癌手術總量位居日本第一。
4. 兒童疑難重癥治療實績超10000例
順天堂醫院的兒童外科，是在日本率先開展兒童內視鏡手術的兒童外科科室。目前，已接收在其他醫院難以治療的疑難重癥兒童患者超過10000例，憑此實績，順天堂的兒童外科在日本兒童外科領域獨占鰲頭。